يتكون مركز التعلم الإلكتروني من أقسام مختلفة مترابطة مع بعضها البعض من أجل تأمين جميع الخدمات الإلكترونية لطلبة الجامعة ولأعضاء الهيئة التدريسية, حيث يوضح الشكل التالي الهيكل التنظيمي للمركز

يتكون المركز من الأقسام التالية
هذا القسم مسؤول عن الأنظمة الإلكترونية المعتمدة في جامعة العلوم التطبيقية الخاصة والمكونة من 4 منصات للتعلم يستخدمها الطالب وعضو هيئة التدريس خلال مسيرته الأكاديمية وجميعها مرتبطة بمنصة واحدة هي Hub.asu.edu.jo:
يندرج تحت هذا القسم مسؤول تطوير منصات التعلم ومسؤول اداري على منصات التعلم والمسؤول التقني على منصات التعلم.
يقوم المركز وبالتعاون مع الكليات المختلفة برقمنة مواد التخصصات المختلفة ضمن الية معتمدة لذلك.
الية تنفيذ رقمنة المواد في الكليات:
سيقوم مركز التعلم الإلكتروني بتدريب المنسبين من الكليات لرقمنة المواد على التالي(إن رغبت الكلية بذلك):
ويندرج تحت هذا القسم مسؤول تصميم المحتوى الرقمي ومصمم الجرافيك والمسؤول البصري.
يعتبر المركز مسؤول عن تدريب أعضاء هيئة التدريس على كيفية أتمتة الامتحانات عبر المنصة المعتمدة ويوفر لهم فيديوهات ارشادية لذلك. هذا بالاضافة الى تأمين حجز المختبرات لتأدية الامتحانات المحوسبة ضمن لجنة المختبرات والامتحانات المركزية في الجامعة.